本发明公开了一种适用于并联逆变器的环流纹波峰值控制方法及控制系统,方法包括:在当前控制周期,当控制器发出单个完整载波时,对三相电压调制信号进行采样,以计算三相占空比,并由此计算每个周期分段的实际作用时间;对于三相中的任意一相,根据每一个周期分段内的相电压压降计算每一个周期分段内的环流纹波斜率,并根据环流纹波斜率和实际作用时间得到每个周期分段内的环流纹波,以由此预测当前控制周期内该相的环流纹波峰值;根据所预测的三相环流纹波峰值计算周期更新值,并利用周期更新值更新并联逆变器的开关周期,从而完成当前控制周期内的环流纹波峰值控制。