本发明涉及智能杀菌设备技术领域,且公开了一种瓶胚杀菌装置,包括传输架,所述传输架的中部开设有滑动槽,所述传输架的内部通过滑动槽活动放置有瓶胚,所述瓶胚的瓶口处卡接有固定手。该瓶胚杀菌装置,通过打断的传输架与齿轮环的配合安装,使得打断的传输架能够在齿轮环的旋转下,通过支撑柱的作用带动传输架转动,从而将瓶胚翻转,瓶胚的瓶身在上,瓶口在下,在后续卡有固定手的瓶胚的推动下,进入下一段传动到螺旋的传输架上在集废管、喷头的配合下进行杀菌处理并将液态的H2O2初步收集,解决了高温H2O2蒸汽在瓶胚内壁形成微冷凝同时会形成液态H2O2,液态H2O2无法排除沉积在瓶胚底部的问题,提升了成平瓶胚内的干净度。